شرکت آمایش و توسعه شرق با مراکز مختلف علمی و پژوهشی ملی و بین المللی و نیز سایر شرکتهای مختلف مشاور جهت همکاری در اجرای طرح ها ، تبادل تجارب و امکانات مختلف تفاهم نامه همکاری دارد . این مراکز به دو گروه ملی و بین المللی تقسیم می شود :

  مراکز علمی و پژوهشی و شرکت های مطالعاتی ملی :         

•  فصلنامه علمی و پژوهشی تحقیقات جغرافیایی 

• فصلنامه توانمندسازی زنان وجامعه پایدار

• پژوهشکده امیر کبیر

• بنیاد فرهنگ و تمدن کاوشگران میراث شرق 

• شرکت سازآب شرق

• شرکت مهندسین مشاور طوس آب  

• شرکت مهندسین مشاور سرو آب

• شرکت  مهندسین مشاور کیانشهر

• شرکت مهندسی مشاور تحقیقات خاک مهارآب 

• انتشارات پاپلی

  مراکز علمی و پژوهشی و شرکت های مطالعاتی بین المللی :

• مرکز ملی تحقیقات علمی فرانسه ( CNRS )

• دانشگاه توبینگن آلمان

• دانشگاه گوته- فرانکفورت آلمان